Профессор М.Д. Шарыгин родился 8 ноября 1938 г. в д. Малое Шарыгино Яранского района Кировской области в крестьянском семье. После окончания средней школы Михаил Дмитриевич поступил в Кировский педагогический институт. Блестяще окончив биолого-географическое отделение института в 1962 г. и отслужив в армии, будущий профессор был принят на кафедру экономической географии родного вуза ассистентом. Здесь начался его путь в большую науку.

В 1966 – 1969 гг. М. Д. Шарыгин учился в очной аспирантуре Пермского государственного университета под руководством Заслуженного деятеля наук Таджикской ССР  профессора В. А. Танаевского. В 1970 г. в диссертационном совете МГУ Михаил Дмитриевич защитил свою первую диссертацию на тему «Формирование и развитие территориально-производственного комплекса Северо-Востока Кировской области». Научно-методологической базой диссертации послужили труды, прежде всего, Н. Н. Колосовского. Концепции энергопроизводственных циклов и территориально-производственных комплексов (ТПК) в то время только начинали находить широкую поддержку у географической общественности. Кандидатская диссертация М. Д. Шарыгина явилась одной из первых, раскрывавших сущность этих идей на конкретных территориальных примерах.

В 1971 г. Михаил Дмитриевич был избран на должность заведующего кафедрой экономической географии Пермского университета, и более 40 лет превосходно выполняет эту работу. Под руководством М. Д. Шарыгина пермская школа социально-экономической географии получила признание внутри страны и за рубежом. Сегодня по праву она именуется научной школой профессора М. Д. Шарыгина.

В 1980 г. Михаил Дмитриевич блестяще защитил докторскую диссертацию «Проблемы дробного экономического районирований и развития локальных территориально-производственных комплексов (на примере Уральского экономического района)», в которой одним из первых в отечественной экономической географии раскрыл теоретико-методологические вопросы исследования территориальной организации производительных сил экономического района путем выделения дробных районов, а также методологические основы управления, планирования и прогнозирования локальных ТПК.

В 1981 г. М. Д. Шарыгину было присвоено ученое звание профессора, а уже в 1982 г. на кафедре экономической географии Пермского университета была открыта аспирантура под его руководством. На сегодняшний день учениками Михаила Дмитриевича являются более 30 человек, из них двое – доктора географических наук.

Профессор М. Д. Шарыгин является одним из наиболее авторитетных ученых-исследователей в области общественной географии. Он внес значительный вклад в развитие таких идей, как теории территориальных социально-экономических систем, территориальных общественных систем, территориальной организации общества, социально-экономического микрорайонирования, интегрального общественно-географическом районирования. Его исследования также охватывают проблемы регионалистики, территориального управления и планирования, теории и методологии общественной географии и географической науки в целом.

Научный «багаж» профессора М. Д. Шарыгина включает более 500 научных работ, среди которых заметное место занимают монографии, учебники и учебные пособия. Среди основных работ необходимо выделить такие фундаментальные труды, как «Экономическая и социальная география: новый этап» (Л., 1990, в соавторстве с А. И. Чистобаевым), «Региональная организация общества» (Пермь, 1992), «Региональная социально-экономическая география» (Пермь, 1994, в соавторстве с Е. Г. Анимицей), «Эколого-экономические районы» (Пермь, 1995, группа авторов), «Социально-экономическая география: современные категории науки» (Самара, 2001, в соавторстве с В. В. Ворониным, А. М. Трофимовым), «Территориальные общественные системы» (Пермь, 2003), «Общая география: вопросы теории и методологии» (Пермь, 2007, в соавторстве с А. М. Трофимовым).

Весомый вклад Михаил Дмитриевич внес и в развитие географического образования. В 1970-90-е гг. он являлся членом Президиума Учебно-методического объединения университетов страны по географическим наукам. Благодаря его всемерной поддержке в Пермском университете были открыты специальность «Социально-культурный сервис и туризм» (2002) и направление бакалавриата «Картография и геоинформатика». С 1998 г. кафедра социально-экономической географии ПГНИУ перешла на систему двухуровневой подготовки специалистов «бакалавриат – магистратура».

Михаил Дмитриевич является многократным лауреатом Пермского университета по науке, лауреатом многочисленных премий. Он награжден дипломом Русского Географического общества «За выдающиеся работы в области географии». Его имя внесено Американским биографическим институтом в список 1000 выдающихся личностей XX века. Творческие и дружеские отношения связывают Юбиляра с представителями ведущих географических центров России и стран Ближнего Зарубежья: Владивостока, Воронежа, Иркутска, Казани, Киева, Краснодара, Москвы, Санкт-Петербурга, Тюмени, Уфы и др.

Михаил Дмитриевич являлся инициатором издания и редактором междуведомственных сборников научных трудов «Территориальные социально-экономические системы Урала» и «Территория и общества», в которых публиковались результаты исследований многих известных отечественных экономико-географов. В настоящее время он является членом редакционных коллегий научных журналов «Географический вестник» (г. Пермь) и «Региональные исследования» (г. Смоленск).

Профессор М. Д. Шарыгин является академиком Международной академии наук высшей школы, Международной академии экологии и безопасности человека и природы, Российской академии естественных наук, Российской академии экологии.